Maladies communes à plusieurs espèces - Brucellose (Brucella abortus)
- Brucellose (Brucella melitensis)
- Brucellose (Brucella suis)
- Cowdriose
- Échinococcose/hydatidose
- Encéphalite japonaise
- Encéphalomyélite équine de l'Est
- Fièvre aphteuse
- Fièvre catarrhale du mouton
- Fièvre charbonneuse
- Fièvre de West Nile
- Fièvre de la Vallée du Rift
- Fièvre hémorragique de Crimée-Congo
- Fièvre Q
- Maladie d'Aujeszky
- Maladie hémorragique épizootique
- Myiase à Chrysomya bezziana
- Myiase à Cochliomyia hominivorax
- Paratuberculose
- Peste bovine
- Rage
- Stomatite vésiculeuse
- Surra (Trypanosoma evansi)
- Trichinellose
- Tularémie
| Maladies des bovins - Anaplasmose bovine
- Babésiose bovine
- Campylobactériose génitale bovine
- Dermatose nodulaire contagieuse
- Diarrhée virale bovine
- Encéphalopathie spongiforme bovine
- Leucose bovine enzootique
- Péripneumonie contagieuse bovine
- Rhinotrachéite infectieuse bovine/vulvovaginite pustuleuse infectieuse
- Septicémie hémorragique
- Theilériose
- Trichomonose
- Trypanosomose (transmise par tsé-tsé)
- Tuberculose bovine
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Maladies des ovins et des caprins - Agalaxie contagieuse
- Arthrite/encéphalite caprine
- Avortement enzootique des brebis (chlamydiose ovine)
- Clavelée et variole caprine
- Épididymite ovine (Brucella ovis)
- Maedi-visna
- Maladie de Nairobi
- Peste des petits ruminants
- Pleuropneumonie contagieuse caprine
- Salmonellose (S. abortusovis)
- Tremblante
| Maladies des équidés - Anémie infectieuse des équidés
- Artérite virale équine
- Dourine
- Encéphalomyélite équine de l'Ouest
- Encéphalomyélite équine vénézuélienne
- Grippe équine
- Métrite contagieuse équine
- Morve
- Peste équine
- Piroplasmose équine
- Rhinopneumonie équine
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Maladies des suidés - Cysticercose porcine
- Encéphalite à virus Nipah
- Gastro-entérite transmissible
- Maladie vésiculeuse du porc
- Peste porcine africaine
- Peste porcine classique
- Syndrome dysgénésique et respiratoire du porc
| Maladies des oiseaux - Bronchite infectieuse aviaire
- Bursite infectieuse (maladie de Gumboro)
- Chlamydiose aviaire
- Hépatite virale du canard
- Influenza aviaire hautement pathogène et influenza aviaire faiblement pathogène chez les volailles conformément au Chapitre 10.4. du Code sanitaire pour les animaux terrestres
- Laryngotrachéite infectieuse aviaire
- Maladie de Newcastle
- Mycoplasmose aviaire (M. gallisepticum)
- Mycoplasmose aviaire (M. synoviae)
- Pullorose
- Rhinotrachéite de la dinde
- Typhose aviaire
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Maladies des lagomorphes - Maladie hémorragique du lapin
- Myxomatose
| Maladies des abeilles - Acarapisose des abeilles mellifères
- Infestation des abeilles mellifères par l'acarien Tropilaelaps
- Infestation par le petit coléoptère des ruches (Aethina tumida)
- Loque américaine des abeilles mellifères
- Loque européenne des abeilles mellifères
- Varroose des abeilles mellifères
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Maladies des poissons - Anémie infectieuse du saumon
- Infection à Gyrodactylus salaris
- Herpèsvirose de la carpe koi
- Iridovirose de la daurade japonaise
- Nécrose hématopoïétique épizootique
- Nécrose hématopoïétique infectieuse
- Septicémie hémorragique virale
- Syndrome ulcératif épizootique
- Virémie printanière de la carpe
| Maladies des mollusques - Infection à Bonamia exitiosa
- Infection à Bonamia ostreae
- Infection à Marteilia refringens
- Infection à Perkinsus marinus
- Infection à Perkinsus olseni
- Infection à Xenohaliotis californiensis
- Infection due au pseudo-herpès de l'ormeau
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Maladies des crustacés - Hépatopancréatite nécrosante
- Maladie de la tête jaune
- Maladie des points blancs
- Maladie des queues blanches
- Myonécrose infectieuse
- Nécrose hypodermique et hématopoïétique infectieuse
- Peste de l'écrevisse (Aphanomyces astaci)
- Syndrome de Taura
| Maladies des amphibiens - Infection à Batrachochytrium dendrobatidis
- Infection à ranavirus
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Autres maladies - Leishmaniose
- Variole du chameau
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