Les Groupes de travail sont chargés de faire un point régulier sur les progrès réalisés dans leur domaine de compétence et d'informer les Commissions Spécialisées et les Pays Membres de l’OIE.

Trois Groupes de travail sont actuellement en activité :

-  Groupe de travail pour les maladies des animaux sauvages
-  Groupe de travail sur le bien-être animal
-  Groupe de travail sur la sécurité sanitaire des aliments